期刊简介
本刊是一份中医药综合性、学术类刊物，由广州中医药大学主办，主管单位为广东省高等教育厅。本刊向国内外公开发行，是中国科技论文统计源期刊，被包括中国核心期刊(遴选)数据库、美国《化学文摘(CA)》、俄罗斯《文摘杂志》、美国《剑桥科学文摘(CSA)》等22个国内外权威检索系统收载；是全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊、全国中医药优秀期刊、广东省优秀期刊、中国期刊方阵双效期刊。读者对象为国内外从事医药教学、科研、临床的专业人员及国内外中医爱好者。
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首页>广州中医药大学学报杂志
- 杂志名称：广州中医药大学学报杂志
- 主管单位：广东省教育厅
- 主办单位：广州中医药大学
- 国际刊号：1007-3213
- 国内刊号：44-1425/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：2004年获全国高校优秀科技期刊评比一等奖期刊收录：剑桥科学文摘, 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
阳春砂基于转录组的萜类合酶基因挖掘及一个单萜合酶基因的克隆
邓可；杨锦芬；王腾；王虹；王焕；苏金锋；詹若挺
关键词：阳春砂, 转录组, 萜类合酶基因, 基因克隆
摘要：[目的]深入挖掘阳春砂转录组中挥发性萜类合酶相关基因,为全面认识阳春砂挥发性萜类代谢途径和分子调控模式奠定基础.[方法]整理前期工作获得的阳春砂2个转录组的数据,筛选已注释的及利用本地blast方法再注释的萜类合成途径的unigene;并通过对部分候选unigene的表达量与挥发性萜类化合物含量的相关性分析及生物信息学分析,进一步筛选出相关基因;采用PCR及重组载体构建的方法克隆其中一个单萜合酶基因,并对其编码蛋白序列进行分析.[结果]筛选得到10个挥发性萜类合成上游途径相关unigene及11个下游萜类合酶基因;相关性分析证明候选基因与阳春砂主要挥发性萜类有较强相关性;并成功克隆得到AvTPS1基因,其序列包含1 803 bp的开放阅读框,编码600个氨基酸;其编码蛋白含有单萜合酶蛋白特有的DDXXD、RRX8W和NSE/DTE等保守基序,N端含有一段叶绿体转运肽;系统进化分析表明AvTPS1属于TPS-b亚家族.[结论]结合转录组、表达谱数据的深入挖掘和与挥发性萜类化合物数据的关联,有效筛选出了阳春砂多个值得后续研究的萜类合酶基因;其中对AvTPS1的克隆及生物信息学分析为后续功能鉴定提供了基础.
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